学院现由资源勘查系、地质工程系、采矿工程系、新疆中亚造山带大陆动力学与成矿预测自治区重点实验室、矿产资源生态环境保护性开采自治区普通高校重点实验室、新疆矿产资源勘探及检测工程研究中心、自治区工程技术研究中心、新疆煤层气工程技术研究中心以及地质与采矿工程自治区实验教学示范中心组成。